Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms