Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms