Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGP1Q92546 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms