Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF12Q8WXF0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms