Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS9Q8WXC6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS9Q8WXC6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS9Q8WXC6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS9Q8WXC6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS9Q8WXC6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS9Q8WXC6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS9Q8WXC6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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