Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf54Q8WWF1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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