Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C7orf43Q8WVR3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms