Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms