Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms