Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms