Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL11Q8NHH1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL11Q8NHH1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTLL11Q8NHH1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTLL11Q8NHH1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL11Q8NHH1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms