Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM3Q8NE01 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms