Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms