Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms