Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms