Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms