Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms