Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9AQ7Z3C6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms