Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CATSPER4Q7RTX7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms