Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms