Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms