Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD6Q6ZSS7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD6Q6ZSS7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD6Q6ZSS7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD6Q6ZSS7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms