Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms