Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCIMPQ6UWF3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCIMPQ6UWF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms