Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms