Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms