Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms