Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUPD1Q68J44 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms