Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102BQ68D86 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102BQ68D86 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms