Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GARNL3Q5VVW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms