Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPRD2Q5VT52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPRD2Q5VT52 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms