Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms