Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms