Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms