Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CT47A1Q5JQC4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47A1Q5JQC4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms