Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms