Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms