Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TBRG1Q3YBR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms