Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms