Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms