Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms