Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms