Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms