Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NBPF8Q3BBV2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms