Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms