Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FHOD3Q2V2M9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FHOD3Q2V2M9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
FHOD3Q2V2M9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FHOD3Q2V2M9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FHOD3Q2V2M9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FHOD3Q2V2M9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
FHOD3Q2V2M9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FHOD3Q2V2M9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms