Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
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