Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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SGCAQ16586 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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