Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms