Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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